清水河镇位于县境东北部，东接四川省。距县府驻地87千米。是通往玉树各县的交通要道。人口0.6万，以藏族为主，占总人口的99.9％。面积0.5万平方千米。辖普桑、尕秦、扎玛、中卡、扎哈、朵措、红旗7个牧委会。1965年成立清水河乡，1970年改设清水河公社，1984年复设清水河乡。

2001年10月15日青海省人民政府青政函[2001]99号文批复：撤销清水河乡，设立清水河镇。.

2014年7月21日，清水河镇被国家住房城乡建设部等七部委确定为全国重点镇。